Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serpina1cQ00896 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms