Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms