Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa1Q00623 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms