Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms