Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou1f1Q00286 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms