Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms