Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1bP97952 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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