Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca2P97929 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca2P97929 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms