Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cry1P97784 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms