Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms