Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms