Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nbr1P97432 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms