Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TnikP83510 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TnikP83510 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TnikP83510 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TnikP83510 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TnikP83510 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnikP83510 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnikP83510 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TnikP83510 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnikP83510 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnikP83510 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms