Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SgcgP82348 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcgP82348 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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