Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SgcdP82347 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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