Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb2P81069 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms