Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx3P81067 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms