Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms