Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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