Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad50P70388 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad50P70388 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad50P70388 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms