Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx3P70354 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms