Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad1P70340 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms