Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cux2P70298 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cux2P70298 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cux2P70298 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cux2P70298 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cux2P70298 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms