Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxna3P70208 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms