Protein–RNA interactions for Protein: P70158

Smpdl3a, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3aP70158 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3aP70158 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3aP70158 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3aP70158 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpdl3aP70158 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpdl3aP70158 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpdl3aP70158 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpdl3aP70158 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpdl3aP70158 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpdl3aP70158 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms