Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn5P68500 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms