Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo1P63166 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms