Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbpl1P62340 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbpl1P62340 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms