Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps13P62301 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps13P62301 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps13P62301 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps13P62301 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms