Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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