Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga11P61622 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms