Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms