Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sem1P60897 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms