Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms