Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd4P58467 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms