Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtdsplP58465 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtdsplP58465 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms