Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms