Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp25P57080 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp25P57080 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp25P57080 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms