Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms