Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmoP56726 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmoP56726 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmoP56726 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmoP56726 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmoP56726 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmoP56726 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmoP56726 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmoP56726 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmoP56726 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms