Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms