Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1P56183 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms