Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Sh3bp1P55194 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Sh3bp1P55194 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Sh3bp1P55194 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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