Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb3P54754 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms