Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad23aP54726 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms