Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cacnb3P54285 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacnb3P54285 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms