Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms