Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms