Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr5P51682 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms