Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1swP51491 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1swP51491 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms